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电气与自动化工程学院成立于20021月,其前身是机电系,始建于19799月,后经历电气工程系、电气与信息工程学院、电气工程学院、电气与电子工程学院、电气与自动化工程学院几个发展阶段。

19931211日,经国务院学位委员会第十二次会议批准,我校成为硕士学位授予单位。铁道牵引电气化与自动化被批准为我校首批硕士学位授予点,于1995年招收硕士研究生,同年被确定为江西省重点学科,1997年更名为交通信息工程及控制。

20063月,电气工程硕士学位授权一级学科获得批准。

20103月,控制科学与工程硕士学位授权一级学科获得批准。

2013年华东交通大学被增列为博士学位授予单位,控制科学与工程、交通运输工程等2个学科为博士学位授权一级学科。

2014年,控制科学与工程学科获批博士后科研流动站。
2017
年,交通运输工程入选江西省一流学科(优势型),控制科学与工程入选江西省一流学科(成长型)。

2017年,在教育部第四轮评估中,控制科学与工程、交通运输工程同为B-(全国30%~40%)。